欧洲水貂的身体幼长及灵活，尾巴多毛，掌上有蹼。它们夏天的毛较稀疏；冬天的毛较密及深色，很适合低温环境。它们的视觉一般较差，故会依赖灵敏的嗅觉来猎食。[2]
有时很难分辨欧洲水貂及美洲水貂，因为它们之间的分别只在上唇有否白斑。有白斑的肯定是欧洲水貂，但没有白斑的则有可能是欧洲或美洲水貂。欧洲水貂的下唇有白色斑点，断断续续或连续的形成腹部斑纹。每一只水貂的腹部斑纹各有不同，故可以此来分辨个别水貂。
欧洲水貂的疤痕处及年长时长的毛都是白色的。雄貂长28-43厘米及重900克；雌貂稍为细少，只长30-40厘米及重600克。整体比美洲水貂细少。[2]